ANALYTICAL METHODS BASED ON MASS SPECTROMETRY USED IN GENOMIC, PROTEOMIC AND METABOLOMIC STUDIES

Mădălina A. Davidescu, C-tin Pascal, A.C. Grădinaru, D. Simeanu, V. Maciuc, Şt. Creangă

Abstract
    This paper reviews the most important aspects of the literature on genomics, proteomics, and metabolomics studies based on analytical methods such as mass spectrometry (MS). Currently, most analyzes in the field of "omic" subjects are performed with mass spectrometers due to reproducible quantitative accuracy, and their ability to evaluate complex biofluids. This technology are faster, more sensitive, more reliable, and more automated than others. A huge demand for a software that can process, analyse, and visualize large data sets has been generated by the ability to characterize more metabolites and allowed by recent improvements in mass spectrometry instrumentation. The application of mass spectrometry to genome annotation presents a number of challenges to standard workflows in genomics.

METODE ANALITICE BAZATE PE SPECTROMETRIE DE MASĂ FOLOSITE ÎN STUDII DE GENOMICĂ, PROTEOMICĂ ŞI METABOLOMICĂ

Mădălina A. Davidescu, C-tin Pascal, A.C. Grădinaru, D. Simeanu, V. Maciuc, Şt. Creangă

Rezumat
   Această lucrare revizuieşte aspecte importante din literatura de specialitate cu privire la studiile de genomică, proteomică şi metabolomică având la bază metode analitice bazate pe spectrometrie de masă. În prezent, majoritatea analizelor din domeniul disciplinelor „omice" sunt efectuate cu spectrometre de masă (SM) datorită preciziei cantitative reproductibile şi capacităţii de a evalua biofluide complexe. Această tehnologie este mai rapidă, mai sensibilă, mai fiabilă şi mai automatizată decât alte metode. Capacitatea de a caracteriza mai mulţi metaboliţi, permisă prin îmbunătăţirile recente în instrumentarea spectrometriei de masă, a condus şi la implementarea unui software care poate procesa, analiza şi vizualiza seturi mari de date. Aplicarea spectrometriei de masă la adnotarea genomului prezintă o serie de provocări pentru fluxurile de lucru standard în genomică.

Cuvinte cheie: cromatografie, metaboliţi, genom, bioinformatică